一、性质不同。检察官特指人民的执检察员，代表国家行使检察职权，具有公务性质而检查员可以存在于任何单位，当然也包括一些执法部门，即使可以行使执法权，但它行使的是行政执法权。
二、职责不同。检察官肩负法律监督职责，而检查员的职责根据不同部门的工作岗位有其不同职责，如卫生检查员检查卫生，消防检查员检查消防等等。