早孕期胎儿大体结构已发育，例如耳部耳壳耳道已经长成，但中枢系统还在继续发育一直到出生。因此伺感官的神经例如内耳伺听觉毛细胞等在妊娠中期才发育。此时如使用损伤听神经的药物可致胎儿失听，因此更应注意对器官尤其功能方面的保护。
中孕期胎儿脑回尚少，有待孕中晚期继续发育。泌尿生殖器的发育孕中晚期也极重要。例如女性胎儿的卵巢分化较晚，约在孕10周后才开始形成卵巢皮质层，16周后才分化发育出大量的卵原细胞及以后的始基卵泡。
孕中晚期如遇不良发育环境仍可出现结构的缺陷。又如孕母发烧同样可以损伤是危害儿脑；噪音环境可以损伤胎儿听神经；睾丸发育中遇障碍可以出现隐睾；外伤或其它原因造成羊膜断裂可致羊膜破裂畸形谱等。因此，孕中期保健仍要注意预防胎儿发育异常；尤其器官功能方面的损伤是危害大出生前又难于发现的，必须从预防着手。
孕期如何预防胎儿畸形
胎儿是否会有不同程度畸形，主要取决于遗传与环境。遗传因素是人力无法改变的，而环境因素则主要是人为因素，其中包括了感染、环境污染、药物摄取等诸多因素。
怀孕的头三个月是胎儿神经管发育的关键期，因此，为了避免胎儿的异常，准妈妈应尽量避免各种不良因素，如烟酒环境，有害化学物质，新装修的房屋，空气不流通的环境等等，并且提高自己免疫力，免受病毒感染，更不要私自服用药物。
为了预防胎儿畸形，孕妇从孕早期开始（最好从计划怀孕开始），就需要补充叶酸。富含叶酸的食物有红苋菜、菠菜、生菜、芦笋、豆类、酵母、动物肝及苹果、柑桔等。
同时，定期做产前检查，配合好医生，也是避免异常新生儿出生的积极手段。
胎儿巨大无论对母体还是对孩子的将来，都有不利的影响。这是因为巨大的胎儿在生产时，虽然此时的产力、产道及胎位均正常，但由于胎儿过大及胎头变形差，当胎头以及胎肩娩出时，常感困难，需行手术助产，如处理不当，可发生子宫破裂，胎儿常因窘迫或手术损伤（如颅内出血）而死亡。
产妇因盆底组织在分娩过程中过度伸张或撕裂，易造成子宫脱垂。对胎儿来讲，出生体重过大，在成人后，发生肥胖的可能性较大，许多慢性病如心血管病、高血压、糖尿病等的发生，均与肥胖有关，所以预防成人疾病应从胎儿做起。