1、精子或卵子或两者均有缺损。形成异常胚胎不能存活而致流产。
2、染色体畸变。自然流产排出物有染色体畸变者占35%。染色体畸变的原因可能是由于孕妇年龄过大，卵母细胞进行减数和排卵太晚，染色体不分离，因而发生畸变，使流产发生率增高，90%的排出物为染色体数目异常。
3、孕卵着床异常。另外，还有母体方面的因素，如母亲全身性疾病、内分泌失调、ABO血型不和、生殖器管畸形等均可导致流产。为寻找流产原因，可作如下检查：血常规，检查胎盘功能，月经前作子宫内膜检查，检测甲状腺功能，糖耐量试验，子宫体、子宫颈造影，查血型和抗体，查流产物有无畸形并作染色体核形分析，精液检查，查血清抗体。